Кион (Kyon) недавно перешел в старшие классы и решил, наконец, оставить детские фантазии о путешествиях во времени, инопланетянах и иных мирах. И вот тут-то появляется эксцентричная девушка по имени Харухи Сузимия (Haruhi Suzimiya), которая с порога заявляет одноклассникам, что не желает иметь дело с заурядными людьми. Если вы не инопланетянин, не прибыли из будущего, или у вас нет телепатических способностей, значит, вам нечем ее заинтересовать.
Из-за скуки и любопытства, Кион заговаривает с этой чудачкой, и сам того не желая, запускает череду странных событий и происшествий, в эпицентре которых всегда оказывается Харухи. В отличие от Киона, у нее множество талантов, так много, что порой возникает подозрение, что она талантлива во всем, будь то спорт, музыка или детективные расследования. Да и люди вокруг нее собираются самые необычные: по странному стечению обстоятельств это всегда оказывается или инопланетная ведьма, или официантка-спецагент из будущего, или юноша телепат. Из всего этого странного сборища единственный заурядный персонаж – сам Кион, которому остается только наблюдать за происходящим.
Вскоре Кион начинает замечать, что Харухи окружают как раз те, кто ей интересен, и что каждый раз, когда ей скучно, случается что-нибудь необычное, и они попадают в новое приключение. Любые ее безумные идеи немедленно воплощаются в жизнь, словно по мановению волшебной палочки или, может быть, по прихоти божества?
Со временем Кион узнает, что у каждого из этой пестрой компании есть свои причины интересоваться Харухи, но в одном их цели сходятся – они должны наблюдать за ней и, если понадобится, как-то развлечь заскучавшего бога.